利用蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)和分子量通過雙向凝膠電泳的方法將各種蛋白質(zhì)區(qū)分開來是一種很有效的手段。它在蛋白質(zhì)組分離技術(shù)中起到了關(guān)鍵作用。如何提高雙向凝膠電泳的分離容量、靈敏度和分辨率以及對蛋白質(zhì)差異表達(dá)的準(zhǔn)確檢測是目前雙向凝膠電泳技術(shù)發(fā)展的關(guān)鍵問題。國外的主要趨勢有**維電泳采用窄pH梯度膠分離以及開發(fā)與雙向凝膠電泳相結(jié)合的高靈敏度蛋白質(zhì)染色技術(shù)，如新型的熒光染色技術(shù)。
 

　　質(zhì)譜技術(shù)是目前蛋白質(zhì)組研究中發(fā)展*快，也*具活力和潛力的技術(shù)。它通過測定蛋白質(zhì)的質(zhì)量來判別蛋白質(zhì)的種類。當(dāng)前蛋白質(zhì)組研究的核心技術(shù)就是雙向凝膠電泳－質(zhì)譜技術(shù)，即通過雙向凝膠電泳將蛋白質(zhì)分離，然后利用質(zhì)譜對蛋白質(zhì)逐一進(jìn)行鑒定。對于蛋白質(zhì)鑒定而言，高通量、高靈敏度和高精度是三個關(guān)鍵指標(biāo)。一般的質(zhì)譜技術(shù)難以將三者合一，而*近發(fā)展的質(zhì)譜技術(shù)可以同時達(dá)到以上三個要求，從而實(shí)現(xiàn)對蛋白質(zhì)準(zhǔn)確和大規(guī)模的鑒定。