奎玲博士等人近期在國際期刊《Frontier in Plant Science》上發(fā)表題為“Identification of Selective Sweeps in the Domesticated Table and Wine Grape (Vitis viniferaL.)”的研究論文,揭示了釀酒葡萄與鮮食葡萄在馴化過程中的選擇信號(hào)與進(jìn)化特征。
葡萄(Vitis viniferassp.vinifera)是世界上*重要的水果之一,它被認(rèn)為在6000-8000年前由其野生祖先V. viniferassp.sylvestris馴化而來。根據(jù)用途,栽培葡萄通常可分為釀酒葡萄、鮮食葡萄或釀酒/鮮食兩用葡萄。釀酒葡萄果穗較緊湊,果粒較小,果皮厚,果肉少;而鮮食葡萄通常果穗較疏松,果粒較大,果皮薄,果肉多。釀酒葡萄的酸度通常為6-9g/L,而鮮食葡萄的酸度通常較低,僅為3-5g/L左右。因此,不管從外表還是內(nèi)在,兩者都有著明顯區(qū)別。然而,兩者是如何在馴化過程中發(fā)生的變化仍缺少比較研究。
在此研究中,研究人員共收集了30個(gè)鮮食葡萄,30個(gè)釀酒葡萄,30個(gè)釀酒/鮮食兩用葡萄資源,以及30個(gè)野生親本的表型與重測序數(shù)據(jù)。表型比較表明,釀酒與鮮食葡萄的果實(shí)重量、酸度和香氣含量存在顯著差異。基于7,522,958個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),研究燃油鑒定得到幾個(gè)重要的選擇掃描區(qū)域,如2號(hào)染色體上性別決定位點(diǎn)外。此外,釀酒葡萄和鮮食葡萄共有四個(gè)高選擇信號(hào)位點(diǎn),然而未檢測到已知的QTL連鎖位點(diǎn)。通過鑒定這些選擇信號(hào)掃描區(qū)域的基因位點(diǎn),可以揭示葡萄馴化過程中受到選擇的重要農(nóng)藝性狀。這些信息不僅揭示了葡萄的適應(yīng)和多樣化的機(jī)制,還將指導(dǎo)葡萄遺傳育種和作物改良。
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