格羅寧根大學(xué)的科學(xué)家對(duì)**用于輸入天冬氨酸的運(yùn)輸復(fù)合物的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了獨(dú)特的繪制。使用冷凍電子顯微鏡對(duì)蛋白質(zhì)成像。結(jié)果表明運(yùn)輸機(jī)工作效率很高。這特別有趣,因?yàn)轭愃频霓D(zhuǎn)運(yùn)蛋白對(duì)于人腦細(xì)胞之間的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)至關(guān)重要。研究結(jié)果于2月21日發(fā)表在《自然通訊》上。
細(xì)胞利用無(wú)數(shù)的運(yùn)輸?shù)鞍讓⑽镔|(zhì)穿梭在它們的膜上:食物和構(gòu)件被進(jìn)口,**和其他廢物被出口。一個(gè)例子是天冬氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,**用來(lái)輸入該氨基酸。格羅寧根生物分子科學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院的Dirk Slotboom教授領(lǐng)導(dǎo)的膜酶研究小組和Albert Guskov博士領(lǐng)導(dǎo)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)小組對(duì)這種轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行了數(shù)年的研究,部分原因是因?yàn)樗侨コ祟愞D(zhuǎn)運(yùn)蛋白的良好模型來(lái)自突觸間隙的神經(jīng)遞質(zhì)谷氨酸,這是我們腦細(xì)胞工作的重要步驟。
貨梯
**膜中的天冬氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是三聚體,這意味著三個(gè)相同的單元緊密地結(jié)合在一起形成一個(gè)復(fù)合物。從環(huán)境中提取天冬氨酸,通過(guò)細(xì)胞膜運(yùn)輸并在細(xì)胞內(nèi)部釋放。每單位三個(gè)鈉離子為這一轉(zhuǎn)變提供動(dòng)力,這可以與貨物提舉相提并論:天冬氨酸和鈉離子與部分轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)合,然后進(jìn)入細(xì)胞。交付天冬氨酸后,它再次退出。
Slotboom解釋說(shuō):“我們以前使用X射線晶體學(xué)繪制了具有天冬氨酸的配合物的結(jié)構(gòu)圖。”這些研究表明,大樓中的三個(gè)電梯始終處于同一位置。“但是,生化證據(jù)表明它們可能彼此獨(dú)立地起作用。”這就是為什么他決定在膜內(nèi)部更自然的環(huán)境中研究運(yùn)輸復(fù)合體的原因。這是使用冷凍電子顯微鏡完成的,這是一種創(chuàng)建蛋白質(zhì)復(fù)合物圖像的方法。
問(wèn)題
將蛋白質(zhì)插入脂質(zhì)雙層的小塊中,并通過(guò)一條蛋白帶將它們保持在一起。這些脂質(zhì)納米盤被快速冷凍并在低溫電子顯微鏡下研究。通過(guò)組合大量圖像,以3.2-3.5埃的分辨率對(duì)運(yùn)輸復(fù)合物成像。
Slotboom小組的博士后研究員,Valentina Arkhipova說(shuō):“我們所看到的與通過(guò)X射線晶體學(xué)獲得的結(jié)構(gòu)有很大不同:在大多數(shù)復(fù)合體中,升降機(jī)處于不同的位置,與獨(dú)立運(yùn)動(dòng)一致。”紙。這就提出了為什么蛋白質(zhì)會(huì)形成三聚體復(fù)合物的問(wèn)題。Arkhipova:“每個(gè)單元的提升部分都需要支撐才能穿過(guò)膜。錨定在膜片內(nèi)部的單個(gè)升降機(jī)可能開(kāi)始擺動(dòng)。但是三臺(tái)帶有相連錨的電梯形成了穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)。”
泄漏
另一種可能性是,三聚體的錨固部分使圍繞它的膜片更薄,更不牢固,這使舉升機(jī)更容易通過(guò)。Slotboom解釋說(shuō):“單體只會(huì)在一側(cè)產(chǎn)生這種作用,因此在能量上不利。”確實(shí),對(duì)包含轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合物的脂質(zhì)納米圓盤的研究顯示了雙層的彎曲。
這些結(jié)構(gòu)還提供了運(yùn)輸系統(tǒng)如何防止鈉泄漏的指示。Slotboom:“升降機(jī)有一種門,當(dāng)它打開(kāi)時(shí)會(huì)伸出并阻止升降機(jī)移動(dòng)。”運(yùn)輸過(guò)程首先需要兩個(gè)鈉離子進(jìn)入提升機(jī)。帶負(fù)電荷的天冬氨酸然后可以在內(nèi)部結(jié)合,這使第三鈉離子進(jìn)入并結(jié)合到門上,從而將門關(guān)閉。因此,升降機(jī)無(wú)法僅運(yùn)輸鈉,鈉會(huì)消散跨驅(qū)動(dòng)運(yùn)輸?shù)哪さ拟c梯度。
大腦
Slotboom說(shuō):“這使系統(tǒng)非常高效”。對(duì)于**而言,這種效率可能只是很小的選擇性進(jìn)化優(yōu)勢(shì)。但是,對(duì)于我們大腦中類似的谷氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋???,它至關(guān)重要。谷氨酸被神經(jīng)細(xì)胞排泄到突觸間隙中,并激發(fā)鄰近的神經(jīng)元。激勵(lì)后,必須非常快速有效地將其去除,以減少信號(hào)傳輸中的噪聲。Slotboom:“對(duì)于這個(gè)系統(tǒng),至關(guān)重要的是沒(méi)有泄漏。”
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