在結(jié)直腸癌(CRC)的發(fā)展中，腺瘤-癌序列的范例通常集中在癌細胞上；然而，現(xiàn)在清楚的是，癌癥進展涉及轉(zhuǎn)化細胞與其周圍微環(huán)境之間的異源相互作用。到目前為止，大多數(shù)研究都依賴于結(jié)直腸癌晚期的批量圖譜來識別癌癥驅(qū)動基因并定義與癌癥相關(guān)的生物學(xué)過程。

近日，來自萊頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)系的研究者們在Gut雜志上發(fā)表了題為“Transcriptomic and immunophenotypic profiling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis”的文章，該研究揭示了早期結(jié)直腸癌腫瘤發(fā)生的分子和**學(xué)景觀。研究者確定了與**進展密切相關(guān)的生物標(biāo)志物，以及可在臨床環(huán)境中利用的有針對性的**過程。

對結(jié)直腸癌(CRC)的逐步發(fā)展和進展的生物學(xué)洞察對于開發(fā)針對這種**的早期發(fā)現(xiàn)和*佳臨床處理的量身定制的方法是必不可少的。在本研究中，研究者的目標(biāo)是剖析伴隨著結(jié)直腸癌惡變的轉(zhuǎn)錄和**學(xué)改變，并通過對PT1結(jié)直腸癌樣本的空間圖譜來識別臨床相關(guān)的生物標(biāo)記物。

研究者在8個PT1癌組織上使用數(shù)字空間圖譜(GeoMx)來研究不同組織學(xué)區(qū)域的上皮和間質(zhì)節(jié)段的基因表達，包括正常黏膜、低度和高度不典型增生和癌。連續(xù)的組織切片通過成像質(zhì)量細胞儀進行分析，以揭示**環(huán)境。*后，對公開獲得的單細胞RNA測序數(shù)據(jù)進行分析，以確定相關(guān)轉(zhuǎn)錄本的細胞來源。

對PT1結(jié)直腸癌樣本中不同區(qū)域的基因表達的比較發(fā)現(xiàn)，在不同的組織結(jié)構(gòu)中，差異表達的基因在上皮(n=1394個基因)和間質(zhì)段(n=1145個基因)中。通路分析發(fā)現(xiàn)，在惡性轉(zhuǎn)化過程中，炎癥反應(yīng)較早發(fā)生，典型的表現(xiàn)為基因信號上調(diào)，如先天**感應(yīng)。

研究者檢測到骨髓細胞浸潤增加，巨噬細胞通過發(fā)育**從正常組織向癌癥轉(zhuǎn)移，從親炎癥的HLA- DR+CD204 -巨噬細胞向HLA- DR - CD204+**抑制亞群轉(zhuǎn)移，同時CD47/ SIRPα“不吃我信號”上調(diào)。

總之，這項研究展示了數(shù)字空間剖面圖在早期結(jié)直腸癌中的應(yīng)用，并對伴隨結(jié)直腸癌逐步進展的生物學(xué)過程提供了見解。本研究的結(jié)果表明先天**在結(jié)直腸癌發(fā)病中起著重要作用。此外，該研究的方法提供了一個框架，用于識別在結(jié)直腸癌發(fā)生過程中持續(xù)變化的生物標(biāo)記物。這些見解為改善早期結(jié)直腸癌患者的臨床管理鋪平了道路。（生物谷 Bioon.com）