2020年3月20日訊/生物谷BIOON/---截至2020年10月,SARS-CoV-2導(dǎo)致了持續(xù)的大流行,全球報告的病例超過3500萬,死亡人數(shù)超過100萬。與SARS-CoV和A型流感病毒相比,在**反應(yīng)方面將COVID-19與SARS區(qū)別開來的一個突出特征是SARS-CoV-2對I型干擾素(IFN)的誘導(dǎo)作用較差。值得注意的是,受損的IFN應(yīng)答與COVID-19**有關(guān)。但是,在SARS-CoV-2感染中低效IFN反應(yīng)的分子機制尚不清楚。
東京大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所(IMSUT)的一個研究小組旨在鑒定決定SARS-CoV-2感染后**激活的病毒因子,并發(fā)現(xiàn)由SARS-CoV-2編碼的基因ORF3b是有效的IFN拮抗劑。
**科學(xué)家,傳染病控制部系統(tǒng)病毒學(xué)副教授Kei Sato說:“ COVID-19患者的IFN反應(yīng)**可能是由于這種病毒產(chǎn)物ORF3b的作用所致。”
盡管SARS-CoV感染會引起急性和嚴重的肺炎,但SARS-CoV-2感染可能是無癥狀的或?qū)е骂愃屏鞲械陌Y狀,例如發(fā)燒,咳嗽和疲勞。而且,與SARS-CoV和A型流感病毒感染相比,SARS-CoV-2感染的標(biāo)志COVID-19是對I型干擾素(IFN)的**誘導(dǎo)。值得注意的是,受損的IFN應(yīng)答與COVID-19的嚴重程度有關(guān)。但是,在SARS-CoV-2感染中低效IFN反應(yīng)的分子機制尚不清楚。
通過比較SARS-CoV-2編碼基因和SARS-CoV的基因序列,研究小組發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2 ORF3b的基因長度明顯短于SARS-CoV ORF3b的基因長度。
因為SARS-CoV的ORF3b被稱為是抗IFN的病毒拮抗劑,所以他們假設(shè)SARS-CoV-2和SARS-CoV之間ORF3b基因長度的差異可能會改變其抗IFN活性,并可能進一步解釋這一差異。這兩種病毒感染的癥狀。
出乎意料的是,SARS-CoV-2 ORF3b是一種比SARS-CoV ORF3b更有效的IFN拮抗劑。系統(tǒng)發(fā)育分析和功能分析表明,蝙蝠和穿山甲的SARS-CoV-2相關(guān)病毒還編碼具有較強抗IFN活性的較短的ORF3b基因產(chǎn)物。
具有增強的抗IFN活性的天然SARS-CoV-2 ORF3b變體的表征
此外,作者對大約17,000個SARS-CoV-2序列的分析確定了一個自然變異,其中重構(gòu)了更長的ORF3b閱讀框。該變體比親本SARS-CoV-2株的ORF3b更有效地抑制IFN。
因此,繼續(xù)監(jiān)測病毒序列以查看在當(dāng)前的大流行期間是否出現(xiàn)新的ORF3b突變將很重要。
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